У четвертій сюжетній лінії ми стежимо за історією Ruri, яка є романтичною історією, як шляхи з Shuffle! і це дуже відрізняється від побічної історії Рурі в Shuffle! Суть+. Вона закохується в Рін, але вона дуже сором'язлива, тому їм потрібен час, щоб сказати одне одному про свої почуття.

У «Справді? Справді!» Рін закохується в Каеде і перебувають у стосунках. Після інциденту, пов’язаного із силою Примули, Каеде впадає в коматозний стан.

Як гарем, Shuffle! насправді не дотримується звичайних тропів персонажів, таких як цундере чи яндере. Елементи є, але вони не помітні. Історія дає погляд на розвиток аніме.

Перемішайте!

У той час як романтичні та сексуальні елементи трьох головних героїв є підтекстом, наступні два дуже гармати, але їхні стосунки дуже нездорові. Голова студентської ради та її помічник. Кірарі Момобамі та Саяка Ігарасі дуже закохані одне в одного.

У справжньому фіналі Сейбер зникає, і Широ слідує за Рін до Лондона, щоб вивчати чаклунство. Вони живуть разом, і Рін обіцяє наглядати за Широ, щоб він не впав у цинізм Арчера. Третій і останній маршрут візуального роману, Heaven's Feel, розповідає про стосунки Широ з Сакура Матоу.