Самці рептилій мають один або два пеніси, гомологічні пенісу ссавців. У разі розмноження рептилій, місцем запліднення є клоака. Після копуляції самець відкладає свою сперму в клоаку самки.

Хоча більшість рептилій розмножуються статевим шляхом деякі здатні до нестатевого розмноження. Запліднення яйцеклітин відбувається всередині організму, процес називається внутрішнім заплідненням. Уся репродуктивна діяльність відбувається всередині клоаки, єдиного виходу/входу біля основи хвоста, де відходи також залишають тіло.

У змій (клас Reptilia; ряд Squamata) геніталії витончені й унікальні. Самці змій мають парні інтромітентні копулятивні органи, які називаються геміпенами, а самки відповідно мають геміклітори, а також вагінальні мішки. (Гредлер та ін.

Репродуктивні стратегії ящірок відрізняються; вони можуть бути: яйцекладні – відкладають яйця (більшість ящірок) яйцеживородні – яйця зберігаються в самці до народження живих дитинчат (усі варани, більшість ігуанід, водяні дракони, усі гекони, більшість хамелеонів)

немає Для більшості змій для розмноження потрібні самець і самка (зробити нових змій). Саме сперма самця «запліднює» яйцеклітину, дозволяючи їй виробляти нову змію.

Більшість рептилій розмножуються статевим шляхом і мають внутрішнє запліднення. У самців є один або два пеніси, які пропускають сперму з клоаки в клоаку самки. Запліднення відбувається всередині клоаки, і запліднені яйця виходять з тіла самки через отвір у клоаці.