Перевагами використання флуоресцентного детектора є його висока чутливість, висока вибірковість і низький фоновий шум. Недоліками є висока вартість, обмежена доступність і проблеми сумісності з деякими розчинниками та колонками.

Переваги цього методу полягають у тому він високочутливий і може використовуватися для вимірювання широкого спектру аналітів. Недоліками є те, що він відносно повільний і на нього можуть впливати перешкоди.

ВЕРХ-флуоресцентна детекція має ряд важливих переваг, у тому числі висока чутливість, висока вибірковість і повторюваність. Найдосконаліші флуоресцентні детектори мають комірку з контрольованою температурою, що забезпечує стабільний аналіз навіть за коливань температури навколишнього середовища.

Висока вибірковість—високоселективний характер флуоресценції є, безперечно, перевагою; однак це також може бути недоліком, оскільки дуже мало молекул природно флуоресціюють. Це перешкоджає легкому та широкому застосуванню флуоресценції в усіх областях молекулярної спектроскопії.

Люмінесцентні лампи зазвичай є високоефективним способом освітлення великої площі, вони ефективніші та служать довше, ніж лампи розжарювання.; однак показано, що використання лише люмінесцентного освітлення негативно впливає на ергономіку та здоров’я.