Мікроглія також була ретельно вивчена на її шкідливу роль у нейродегенеративних захворюваннях, таких як Хвороба Альцгеймера, хвороба Паркінсона, розсіяний склероз, а також серцеві захворювання, глаукома, вірусні та бактеріальні інфекції.

Мікроглія є резидентні імунні ефекторні клітини центральної нервової системи (ЦНС), які швидко реагують на будь-які збурення, щоб підтримувати гомеостаз ЦНС.

Аномальна активація та функція мікроглії змінюють нейрогенез у зубчастій звивині гіпокампу, що, у свою чергу, має наслідки для різноманітних нейродегенеративних захворювань, включаючи бічний аміотрофічний склероз (БАС), хорею Гентінгтона (ХХ), хворобу Паркінсона (ПД), деменцію з тільцями Леві (ЛБД) та …

При патологічних станах надмірно активована мікроглія сприяють пошкодженню нейронів, вивільняючи шкідливі речовини, включаючи запальні цитокіни, активні форми кисню та протеїнази, але вони можуть забезпечити відновлення тканин шляхом вивільнення протизапальних цитокінів і нейротрофічних факторів.

Мікрогліальну дисфункцію пов’язують із нейродегенеративними захворюваннями. Живе зображення мікроглії сітківки у молодих і літніх мишей показало, що літня мікроглія демонструє повільнішу рухливість процесів у гомеостатичному стані та повільнішу реакцію міграції на спричинене лазером вогнищеве пошкодження тканини (Damani et al., 2011).