Одна з широко поширених теорій полягає в тому, що енграма утворюється групою нейронів, активних під час навчання, які зазнають біохімічних і фізичних змін, щоб зберегти інформацію в стабільному стані, і які пізніше знову активуються під час виклику пам’яті.

Теорія біохімічних систем — це основа математичного моделювання біохімічних систем на основі звичайних диференціальних рівнянь (ОДР), у яких біохімічні процеси представлені за допомогою степеневих розкладів за змінними системи.

Пам'ять заснована на тристороння взаємодія нейронів, nECM і мікроелементів. Тристоронній механізм передбачає низьку енергетику з високою швидкістю/обчислювальними можливостями.

Передача пам’яті пропонує хімічну основу для пам’яті, яка називається РНК пам’яті, яка може передаватися через плоть замість непошкодженої нервової системи. Оскільки РНК кодує інформацію, живі клітини виробляють і модифікують РНК у відповідь на зовнішні події, її також можна використовувати в нейронах для запису стимулів.

Коли формуються довготривалі спогади, гіпокамп отримує інформацію з робочої пам’яті та починає змінювати фізичні нейронні зв’язки мозку.. Ці нові зв’язки між нейронами та синапсами залишаються доти, доки вони використовуються. Психологи поділяють довготривалу пам'ять на два типи тривалості: недавню і віддалену.

Різні групи нейронів (нервових клітин), відповідальних за різні думки або сприйняття, дрейфують і виходять з ладу. Пам'ять – це реактивація певної групи нейронів, утворена в результаті постійних змін міцності зв'язків між нейронами.